В России организована и действует справочная лаборатория МЭБ по гриппу птиц в ФГБУ «ВНИИЗЖ» (г. Владимир), где подтверждается диагноз на грипп птиц. Всего в России 34 федеральных государственных бюджетных учреждения Россельхознадзора, где проводится диагностика гриппа птиц. Выделяется вирус, определяется геном вируса, секвенирование изолята с целью определения происхождения вируса.
В 2016г. грипп птиц регистрировался в 36 странах, а высокопатогенный грипп – в 13 странах мира. В Египте и Индонезии высокопатогенный грипп птиц А (H5N1) признан эндемичным. В странах Ближнего и Дальнего Востока, Центральной Азии распространены низкопатогенные вирусы Н9N2, для которых характерно генетическое разнообразие. Люди не болеют низкопатогенным вирусом гриппа.
В России в 2011-2015гг. случаев высокопатогенного гриппа птиц среди домашних и диких птиц не зарегистрировано. Первые очаги гриппа птиц выявлены в ноябре 2016 г. на территориях двух населенных пунктов в Яшалтинском районе Республики Калмыкия. Павшие 137 голов и 66 голов условно здоровой птицы в хозяйствах граждан (куры, гуси, цесарки) были уничтожены. В декабре 2016 г. режим карантина по гриппу птиц на территории Яшалтинского района отменен.
В декабре 2016 г. грипп птиц выявлен на Харабалинской птицефабрике в Астраханской области. По состоянию на 10 января 2017 г. все поголовье птицы в количестве 649226 голов убито бескровным методом и уничтожено сжиганием. В настоящее время осуществляется выявление и уничтожение реализованной продукции неблагополучной птицефабрики. Возвращено и уничтожено сжиганием 3125,1 тыс. штук яиц, 10,1 тонн мяса птицы, 785 кг. фарша и 319 кг. субпродуктов (крылышки).
В декабре 2016 г. очаг гриппа птиц выявлен в ЛПХ на территории ст. Чебургольская в Красноармейском районе Краснодарского края. По состоянию на 10 января 2017 г. мероприятия по ликвидации очага гриппа в ст. Чебургольская завершены, уничтожено 86 голов птицы.
В декабре 2016 г. очаг гриппа выявлен на территории х. Кувичинский в Крымском районе Краснодарского края. В очаге утилизировано 600 голов павшей птицы, кроме того отчуждено и уничтожено 5478 голов гусей и уток. Проводятся работы по выявлению и отчуждению птицы в хозяйствах граждан, проживающих в угрожаемой зоне.
В декабре 2016 г. грипп птиц выявлен на отдельных участках индейководческих предприятий ООО «Евродон» и ООО «Евродон-Юг», расположенных на территориях Красносулинского и Октябрьского районов Ростовской области. В рамках борьбы с пастереллезом птиц, было убито бескровным методом свыше 800 тыс. голов индеек. После выявления вируса гриппа на участках выращивания № 8 и № 10 ООО «Евродон» уничтожено около 221,5 тыс. голов индеек. Ветеринарной службой Ростовской области проводится вакцинация птицы против гриппа в населенных пунктах Красносулинского и Октябрьского районов.
В 2017 году выявлены новые очаги гриппа птиц.
4 января в Апшеронском районе Краснодарского края на территории биопруда ООО «Водоканал Апшеронского района» обнаружено 84 трупа лебедей, павших от гриппа, все они уничтожены сжиганием.
6 января на берегу Динского залива вблизи поста ДПС пос. Ильича обнаружено 38 трупов лебедей, павших от гриппа, все они уничтожены.
6 января при исследовании патматериала от 12 трупов разных птиц, павших в зоопарке г. Воронежа, во всех пробах выявлен геном вируса гриппа А птиц подтипа Н5. Вся восприимчивая птица на территории зоопарка в количестве 176 голов уничтожена.
12 января 2017г. при исследовании в ФГБУ «Краснодарская МВЛ» проб патологического материала кур, павших в ЛПХ на территории пгт. Ойсхара в Гудермесском районе Чеченской Республики, выявлен генетический материал гриппа А птиц.
В феврале 2017 г. в Московской области зафиксирована вспышка птичьего гриппа. Очаги выявлены на двух подмосковных птицефабриках: первый находится около поселка Биокомбинат в Щелковском районе, а второй — в Сергиево-Посадском районе.
Анализ показал наличие штамма H5N8. По словам вирусологов, он не опасен для человека, но высокопатогенен для птицы.
31 марта и 1 апреля 2017 года в результате исследований помета птиц (утка одомашненная – кряква), проведенных Тульским филиалом Центральной научно-методической ветеринарной лаборатории ( ФГБУ «ЦНМВЛ»), принадлежащих гражданину Черкасову В.Н. (Тульская область, Алексинский район, д. Малышево), выявлен геном вируса гриппа птиц подтипа А субтип Н9. Диагноз подтвержден ФГБУ «ВНИИЗЖ» 3 апреля 2017 года. Населенный пункт находится вблизи р. Упа и озера, что не исключает возможность заноса вируса перелетными птицами в связи с началом весенней миграции.